Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Csnk2a2O54833 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csnk2a2O54833 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms