Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brs3O54798 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms