Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
DffbO54788 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DffbO54788 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DffbO54788 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DffbO54788 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DffbO54788 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DffbO54788 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DffbO54788 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms