Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctnnd2O35927 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms