Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn1mwO35599 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms