Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf5O35445 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rnf5O35445 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf5O35445 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf5O35445 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf5O35445 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf5O35445 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf5O35445 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rnf5O35445 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf5O35445 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf5O35445 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf5O35445 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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