Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-ObO35424 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H2-ObO35424 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms