Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Abcc1O35379 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc1O35379 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc1O35379 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms