Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kcnk3O35111 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Kcnk3O35111 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Kcnk3O35111 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Kcnk3O35111 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Kcnk3O35111 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Kcnk3O35111 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Kcnk3O35111 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Kcnk3O35111 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Kcnk3O35111 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Kcnk3O35111 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnk3O35111 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Kcnk3O35111 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Kcnk3O35111 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnk3O35111 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Kcnk3O35111 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Kcnk3O35111 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms