Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cldn4O35054 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn4O35054 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms