Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcshO08795 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrkcshO08795 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms