Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dctn1O08788 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dctn1O08788 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms