Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp6O08738 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp6O08738 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Casp6O08738 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Casp6O08738 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Casp6O08738 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Casp6O08738 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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