Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Barx2O08686 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Barx2O08686 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Barx2O08686 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Barx2O08686 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms