Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sec22bO08547 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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