Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MsmbO08540 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MsmbO08540 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MsmbO08540 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MsmbO08540 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MsmbO08540 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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