Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ascl4M0QW46 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms