Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm4340L7N2C4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm4340L7N2C4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms