Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20939L7N243 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20939L7N243 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms