Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms