Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5225J3QPL3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5225J3QPL3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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