Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ccdc180J3QNE4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Ccdc180J3QNE4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Ccdc180J3QNE4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms