Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6594J3QM43 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6594J3QM43 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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