Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Gm21060J3KMU4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms