Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm21818J3KMS6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm21818J3KMS6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Gm21818J3KMS6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm21818J3KMS6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Gm21818J3KMS6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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