Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms