Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn20G5E8X0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms