Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tubgcp6G5E8P0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tubgcp6G5E8P0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tubgcp6G5E8P0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms