Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HrcG5E8J6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
HrcG5E8J6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HrcG5E8J6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms