Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Speer4cG3UXD1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Speer4cG3UXD1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms