Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms