Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arid4aF8VPQ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms