Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttc37F8VPK0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ttc37F8VPK0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc37F8VPK0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms