Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms