Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5624F6ZZG8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5624F6ZZG8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms