Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
3110082J24RikF6Z6Z2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms