Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Gm10378F6XQQ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Gm10378F6XQQ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Gm10378F6XQQ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Gm10378F6XQQ1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Gm10378F6XQQ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Gm10378F6XQQ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Gm10378F6XQQ1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Gm10378F6XQQ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Gm10378F6XQQ1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Gm10378F6XQQ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm10378F6XQQ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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