Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm5861F6VCN9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm5861F6VCN9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms