Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms