Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prl3d2F6R3P9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prl3d2F6R3P9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms