Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Erich3F6QRE9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms