Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TrdnE9Q9K5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms