Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc146E9Q9F7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms