Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcmdc2E9Q956 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcmdc2E9Q956 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms