Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cdhr2E9Q7P9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdhr2E9Q7P9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdhr2E9Q7P9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms