Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Urb2E9Q7L1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms