Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Arhgef5E9Q7D5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Arhgef5E9Q7D5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arhgef5E9Q7D5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms