Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Simc1E9Q6E9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms