Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc85cE9Q6B2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms