Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
8030474K03RikE9Q4Y8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms